Жаль, что мое эпичное 1к страничное издание ВК запрятано в дебрях антресолей и я не могу посмотреть календарь тех событий. Но если память не изменяет, Балин (тот гном, кто повел группу) погиб под самый конец 2го тысячелетия, в то время как события ВК развиваются уже в третьем. Лет так 20 спустя. Гномы не самые расторопные существа. Как передавать знаки своему народу из недр Мории, полной орков? От них, в общем-то, никто и не ждал ежедневных писем. Но когда не было весточек лет так 15, гномы явно забеспокоились и отправили Гимли в Ривенделл к Элронду, чтобы узнать судьбу Балина. И там уже рыжебородый партнер Леголаса встречает братство и вместе с ними идет в Морию, слабо представляя, что его там ждет. Он все еще верит, что Балин жив и уже даже что-то отстроил в глубинах Мории.

Ну а разложившиеся скелеты - скорее всего за 20 лет так и случается, если оставить труп на полу в окружени орков и крыс.

Аркенстон был погребен вместе с Торином.
Золото было поделено на несколько частей и досталось как гномам, так и жителям Эсгарота.
Даин II (Со свинюшкой) выживает и становится Королем-под-Горой заместо погибшего Торина.

Про эльфийских баб сказать ничего не могу, потому что "никанон!".